При разведении морских свинок большое значение имеет хороший подбор производителей. Они должны быть здоровыми, упитанными, крепкими и энергичными, обладать хорошими качествами, передаваемыми потомству. 

При подборе пары животных оценивают по следующим показателям: по конституции, экстерьеру (телосложению), живому весу, качеству шерсти, плодовитости и производительности. Только после этого подбирают животных для спаривания. Основным принципом подбора должен быть — "лучших к лучшим". 

Молодняк для разведения лучше подбирать из летних окотов от многоплодных и молочных здоровых свинок. Самки должны быть немного мельче, чем самцы, здоровые, упитанные, в хорошей форме, шерсть у них должна быть блестящая и с хорошо выраженным цветом. Только такие особи могут передать потомству признаки породы. Самцы же отбираются взрослые, с шерстью хорошего качества и цвета. Бывают случаи, когда от правильно подобранных производителей с известной родословной получается приплод низкого качества. Но из-за этого расстраиваться не стоит, так как стандартные признаки породы могут восстановиться в следующих пометах. 

Ввиду трудности получения хороших экземпляров пестрой разновидности, например, голландской, особое внимание обращают на распределение окраски у производителей и соответствие ее стандарту. При разведении жесткошерстных морских свинок нужно обращать внимание на качество волосяного покрова и расположение розеток исходя из требований стандарта. Случать самку более двух раз в году не рекомендуется; при частых спариваниях она ослабевает и дает некачественное потомство, которое плохо развивается и часто гибнет. Самцы также при частом спаривании истощаются, и самки нередко остаются неоплодотворенными. 

Зверьки, отобранные для разведения, должны отвечать всем требованиям, которые предъявляются к производителям. Очень упитанные, ожиревшие часто бывают бесплодными. Таким самцам и самкам при подготовке к случному периоду в течение недели за счет жиров и углеводов уменьшают рацион и дают возможность больше бегать. Однако питание при этом должно быть разнообразным и полноценным, включать сочные, богатые витаминами корма. 

В период случки нужно увеличить норму кормов, богатых витамином Е (проросшие зерна пшеницы, ячменя, овса и сочная растительность). Следует также контролировать содержание в кормах и других витаминов, прежде всего А, В, С и, особенно, D. 
У самок следует учитывать плодовитость и материнские качества. Очень важно подобрать многомолочных самок, так как молочные качества передаются по наследству. Нельзя оставлять самок, поедающих свое наследство, а также имеющих злобный характер. Нельзя спаривать родственных по крови животных. Родственное разведение ослабляет жизненность и качество потомства. 

При моногамическом содержании и разведении (1 самец + 1 самка) пара может постоянно оставаться неразлучной. Отделение самца от самки не является неизбежным, так как отцы, как правило, дружелюбно относятся к новорожденным. Разумеется, для начала следует понаблюдать, не ведет ли себя самец агрессивно. До более серьезных конфликтов, связанных с соперничеством за право предводительства в стаде, дело может дойти тогда, когда дети мужского пола достигнут зрелости. Решаясь на то, чтобы оставить самца с остальной семьей, вы должны помнить, что в течение нескольких часов после родов у самки будет течка, и она может снова забеременеть. 

Морских свинок можно содержать и разводить по гаремной системе (1 самец + несколько самок). В таком случае по мере развития беременности самки переносятся в отдельные помещения, чтобы внезапно встревоженное стадо не могло затоптать новорожденных. Несколько матерей могут воспитывать детей вместе только на действительно большой площади. Самки живут при этом в гармонии и согласии, кормя не только свое потомство, но и приплод других самок.